Не білу керек
- FNA файлы - FASTA пішіміндегі ДНҚ және ақуыз тізбегін туралау файлы.
- Geneious көмегімен біреуін ашыңыз.
- Сол бағдарламамен FASTA және ұқсас пішімдерге түрлендіру.
Бұл мақалада FNA файлы деген не, оны қалай ашу керек және оны FASTA, GB, VCF, кескіндер, т.б. басқа пішімге сақтау жолы түсіндіріледі.
FNA файлы дегеніміз не?
FNA файл кеңейтімі бар файл молекулалық биология бағдарламалық құралы пайдаланатын ДНҚ ақпаратын сақтайтын FASTA пішіміндегі ДНҚ және ақуыз ретін теңестіру файлы.
FNA файлдары, әсіресе, нуклеин қышқылы туралы ақпаратты сақтау үшін пайдаланылуы мүмкін, ал басқа FASTA пішімдері FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ сияқты ДНҚ-ға қатысты басқа ақпаратты қамтиды., NET немесе AA файл кеңейтімдері.
Бұл мәтінге негізделген FASTA пішімдері бастапқыда бірдей атпен бағдарламалық пакеттен пайда болды, бірақ қазір ДНҚ және ақуыз тізбегін туралау қолданбаларында стандарт ретінде пайдаланылады.
FNA сондай-ақ бұл файл пішіміне еш қатысы жоқ кейбір технологиялық терминдерге қатысты, мысалы, желіні түпкілікті қабылдау, файл атауын/атрибуттарын ұлғайту құралы, Fujitsu желі архитектурасы және жылдам көрші жарнамасы.
FNA файлын ашу әдісі
Бірін Windows, macOS және Linux жүйелерінде Geneious көмегімен ашыңыз (ол 14 күн бойы тегін). Мұны істеу үшін Файл > Импорттау мәзіріне өтіп, файлды Файлдан арқылы импорттауды таңдаңыз.мәзір элементі.
Сонымен қатар біреуін BLAST Ring Image Generator (BRIG) арқылы ашуға болады.
Егер бұл идеялар орындалмаса, Notepad++ немесе басқа мәтін өңдегішін қолданып көріңіз. Файл шынымен мәтінге негізделген және оқуға оңай болуы мүмкін немесе оның FASTA пішіміне еш қатысы жоқ екенін білуіңіз мүмкін, бұл жағдайда файлды мәтіндік құжат ретінде ашу файлды жасау үшін не пайдаланылғанын анықтайтын мәтінді көрсетуі мүмкін. немесе файл қандай форматта.
FNA файлын түрлендіру жолы
Біз мұны тексеріп көрмегендіктен растай алмаймыз, бірақ файлды FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, сияқты көптеген басқа пішімдерге түрлендіру үшін Geneious қолданбасын пайдалана алуыңыз керек. NEX, PHY, SAM, TSV және VCF. Мұны бағдарламаның Файл > Экспорттау мәзірі арқылы жасауға болады.
Сол бағдарлама файлды Файл > Кескін файлы ретінде сақтау арқылы PNG, JPG, EPS немесе PDF форматында сақтай алуы керек..
Әдетте файл кеңейтімінің атын басқа нәрсеге өзгертіп, оның дәл осылай жұмыс істеуін күте алмасаңыз да, егер нақты ДНҚ секвенирлеу бағдарламалық құралы тек танитын болса,. FNA файлының атын. FA файлына өзгертуге болады. FA пішімі.
Файл кеңейтімдерінің атын өзгертудің орнына басқа файл түрлерін түрлендіру үшін тегін файл түрлендіргішін пайдаланғыңыз келеді. FNA және FA файлдары бар жағдайда, кейбір бағдарламалар тек FA файл кеңейтімі бар файлдарды ашады, бұл жағдайда оның атын өзгерту жақсы жұмыс істеуі керек.
Оны әлі аша алмайсыз ба?
Егер жоғарыдағы бағдарламаларды пайдаланғаннан кейін файлыңызды әлі ашу мүмкін болмаса, файл кеңейтімі іс жүзінде. FNA оқымайды, бірақ оның орнына ұқсас нәрсе көрінуі мүмкін.
Мысалы, FNG (Font Navigator Group) файлдары ". FNA" сияқты өте қорқынышты көрінеді, бірақ мұқият қарасаңыз, тек алғашқы екі әріп бірдей. Файл кеңейтімдері әртүрлі болғандықтан, бұл олардың басқа файл пішімінде екенін және бірдей бағдарламалармен жұмыс істемейтінін көрсетеді.
ФАКС, FAS (құрастырылған жылдам жүктелетін автоLISP), FAT, FNTA (Aleph бір қаріп), FNC (Vue функциялары) және FND (Windows сақталған іздеу) сияқты көптеген басқа файл кеңейтімдері үшін де солай деуге болады.
Мұндағы идея файл кеңейтімі. FNA деп оқитынына көз жеткізу. Егер солай болса, оны ашу немесе түрлендіру үшін жоғарыдағы бағдарламаларды пайдаланып көріңіз. Егер сізде басқа файл болса, оны ашу немесе түрлендіру үшін қандай қолданбалар қажет екенін білу үшін оның кеңейтімін зерттеңіз.
ЖҚС
Python-да FNA файлын қалай ашасыз?
Біріншіден, Geneious сияқты үшінші тарап қолданбасын пайдаланып FNA файлын FASTA пішіміне түрлендіріңіз. Содан кейін сіз биоинформатикадағы жұмыс үшін биологиялық есептеуге арналған еркін қолжетімді құралдар жиынтығын Biopython жүктеп ала аласыз. Соңында, FASTA файлдарымен жұмыс істеу нұсқауларын Biopython оқулығы мен аспаздық кітабынан қараңыз.
Ancestry raw файлындағы FNA жасаушы нөмірлерін қалай табуға болады?
ДНҚ деректерінің көпшілігін Ancestry.com сайтынан.txt пішімінде жүктеп алуға болады. Дегенмен, ДНҚ келесі ұрпақ секвенциясы (NGS) арқылы талданған тұтынушылар ғана VCF файлын жүктеп алу мүмкіндігіне ие. VCF файлын жүктеп алу үшін сіз ДНҚ иесі болуыңыз керек, ДНҚ NGS технологиясы арқылы сыналған және құрылғыңызда кемінде 350 МБ бос орын болуы керек.
